| ミエンドウ | えんどう（豌豆） | マメ科 | 〔草〕 | |
| ミオソティス | わすれなぐさ（勿忘草、忘れな草） | ムラサキ科 | 〔草〕 | |
| ミカエリソウ | ＊ | みかえりそう（見返草） | シソ科 | 〔樹木〕 |
| ミカン | うんしゅうみかん（温州蜜柑） | ミカン科 | 〔樹木〕 | |
| ミカンバガクアジサイ | ＊ | みかんばがくあじさい（蜜柑葉額紫陽花） | アジサイ科 | 〔樹木〕 |
| ミクリ | ＊ | みくり（実栗） | ガマ科 | 〔草〕 |
| ミケーリア・マウディアエ | みやまがんしょう（深山含笑） | モクレン科 | 〔樹木〕 | |
| ミケリア | みやまがんしょう（深山含笑） | モクレン科 | 〔樹木〕 | |
| ミケリア・アルバ | ぎんこうぼく（銀厚朴） | モクレン科 | 〔樹木〕 | |
| ミケルマスデージー | ゆうぜんぎく（友禅菊） | キク科 | 〔草〕 | |
| ミコシグサ | げんのしょうこ（現の証拠） | フウロソウ科 | 〔草〕 | |
| ミシマサイコ | ＊ | みしまさいこ（三島柴胡） | セリ科 | 〔草〕 |
| ミズアオイ | ＊ | みずあおい（水葵） | ミズアオイ科 | 〔草〕 |
| ミズアサガオ | みずおおばこ（水大葉子、水車前草） | トチカガミ科 | 〔草〕 | |
| ミズオオバコ | ＊ | みずおおばこ（水大葉子、水車前草） | トチカガミ科 | 〔草〕 |
| ミズガラシ | クレソン（Cresson） | アブラナ科 | 〔草〕 | |
| ミズカンナ | ＊ | みずカンナ（水Cannna） | クズウコン科 | 〔草〕 |
| ミズキ | ＊ | みずき（水木） | ミズキ科 | 〔樹木〕 |
| ミズギボウシ | ＊ | みずぎぼうし（水擬宝珠） | ユリ科 | 〔草〕 |
| ミスグサ | がま（蒲、香蒲） | ガマ科 | 〔草〕 | |
| ミズスギ | ＊ | みずすぎ（水杉） | ヒカゲノカズラ科 | 〔草〕 |
| ミズタマソウ | ＊ | みずたまそう（水玉草） | アカバナ科 | 〔草〕 |
| ミストフラワー | コノクリニウム・コエレスティウム（Conoclinium coelestinum） | キク科 | 〔草〕 | |
| ミズナ | ＊ | みずな（水菜） | アブラナ科 | 〔草〕 |
| ミズナギ | こなぎ（小菜葱、小水葱、子水葱、子菜葱） | ミズアオイ科 | 〔草〕 | |
| ミズナギ | みずあおい（水葵） | ミズアオイ科 | 〔草〕 | |
| ミズナラ | ＊ | みずなら（水楢） | ブナ科 | 〔樹木〕 |
| ミズバショウ | ＊ | みずばしょう（水芭蕉） | サトイモ科 | 〔草〕 |
| ミズハンゲ | みつがしわ（三槲、三柏） | ミツガシワ科 | 〔草〕 | |
| ミズヒキ | ＊ | みずひき（水引） | タデ科 | 〔草〕 |
| ミズヒキグサ | みずひき（水引） | タデ科 | 〔草〕 | |
| ミズヒキソウ | みずひき（水引） | タデ科 | 〔草〕 | |
| ミズマツ | すいしょう（水松） | スギ科 | 〔樹木〕 | |
| ミスミソウ | ＊ | みすみそう（三角草） | キンポウゲ科 | 〔草〕 |
| ミズメ | ＊ | みずめ（水芽） | カバノキ科 | 〔樹木〕 |
| ミズワサビ | わさび（山葵） | アブラナ科 | 〔草〕 | |
| ミセバヤ | ＊ | みせばや（見せばや） | ベンケイソウ科 | 〔草〕 |
| ミソガソウ | みそがわそう（味噌川草） | シソ科 | 〔草〕 | |
| ミソガワソウ | ＊ | みそがわそう（味噌川草） | シソ科 | 〔草〕 |
| ミゾソバ | ＊ | みぞそば（溝蕎麦） | タデ科 | 〔草〕 |
| ミソハギ | ＊ | みそはぎ（禊萩） | ミソハギ科 | 〔草〕 |
| ミチシバ | ちからしば（力芝） | イネ科 | 〔草〕 | |
| ミツガシワ | ＊ | みつがしわ（三槲、三柏） | ミツガシワ科 | 〔草〕 |
| ミツカドネギ | ＊ | みつかどねぎ（三角葱） | ユリ科 | 〔草〕 |
| ミッキーマウスノキ | ミッキーマウスノキ（Mickymouseの木） | オクナ科 | 〔樹木〕 | |
| ミッキーマウスプランツ | ミッキーマウスノキ（Mickymouseの木） | オクナ科 | 〔樹木〕 | |
| ミツデ | かくれみの（隠れ蓑） | ウコギ科 | 〔樹木〕 | |
| ミツデイワガサ | ＊ | みつでいわがさ（三つ手岩傘） | バラ科 | 〔樹木〕 |
| ミツデカエデ | ＊ | みつでかえで（三手楓） | カエデ科 | 〔樹木〕 |
| ミツデコトジソウ | ＊ | みつでことじそう（三手琴柱草） | シソ科 | 〔草〕 |
| ミツナガシハ | おおたにわたり（大谷渡） | チャセンシダ科 | 〔草〕 | |
| ミツナガシワ | かくれみの（隠れ蓑） | ウコギ科 | 〔樹木〕 | |
| ミツバアケビ | ＊ | みつばあけび（三葉木通） | アケビ科 | 〔樹木〕 |
| ミツバイワガサ | みつでいわがさ（三つ手岩傘） | バラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミツバウツギ | ＊ | みつばうつぎ（三葉空木） | ミツバウツギ科 | 〔樹木〕 |
| ミツバカイドウ | ずみ（酢実） | バラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミツバコトジソウ | みつでことじそう（三手琴柱草） | シソ科 | 〔草〕 | |
| ミツバシモツケ | みつばしもつけそう（三つ葉下野草） | バラ科 | 〔草〕 | |
| ミツバシモツケソウ | ＊ | みつばしもつけそう（三つ葉下野草） | バラ科 | 〔草〕 |
| ミツバツツジ | ＊ | みつばつつじ（三葉躑躅 ） | ツツジ科 | 〔樹木〕 |
| ミツバハマゴウ | ＊ | みつばはまごう（三葉浜栲） | クマツヅラ科 | 〔樹木〕 |
| ミツマタ | ＊ | みつまた（三椏／三叉） | ジンチョウゲ科 | 〔樹木〕 |
| ミドリハカタカラクサ | のはかたからくさ（野博多唐草） | ツユクサ科 | 〔草〕 | |
| ミドリハコベ | はこべ（繁縷） | ナデシコ科 | 〔草〕 | |
| ミドリハナヤサイ | ブロッコリー（Broccoli） | アブラナ科 | 〔草〕 | |
| ミナヅキ | ＊ | みなづき（水無月） | アジサイ科 | 〔樹木〕 |
| ミナミザクラ | かわづざくら（河津桜） | バラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミナロバータ | ＊ | ミナロバータ（Mina lobata） | ヒルガオ科 | 〔草〕 |
| ミニアイリス | ＊ | ミニアイリス（Mini Iris） | アヤメ科 | 〔草〕 |
| ミニアチュア・サンデュー | ひめはなびしそう（姫花菱草） | ケシ科 | 〔草〕 | |
| ミニトマト | ＊ | ミニトマト（Mini tomato） | ナス科 | 〔草〕 |
| ミニバラ | ばら（薔薇） | バラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミニホリホック | シダルケア（Sidalcea） | アオイ科 | 〔草〕 | |
| ミネザクラ | ＊ | みねざくら（峰桜、嶺桜） | バラ科 | 〔樹木〕 |
| ミノスゲ | かさすげ（笠菅） | カヤツリグサ科 | 〔草〕 | |
| ミブナ | ＊ | みぶな（壬生菜） | アブラナ科 | 〔草〕 |
| ミミカキグサ・ロンギフォリア | ウトリクラリア・ロンギフォリア（Utricularia longifolia） | タヌキモ科 | 〔草〕 | |
| ミムラサキ | むらさきしきぶ（紫式部） | クマツヅラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミムラサキ | むらさきしきぶ（紫式部） | クマツヅラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミムラス | ＊ | ミムラス（Mimulus） | ゴマノハグサ科 | 〔草〕 |
| ミモザ | ふさアカシア（房Acacia） | マメ科 | 〔樹木〕 | |
| ミモザ | ぎんようアカシア（銀葉Acacia） | マメ科 | 〔樹木〕 | |
| ミモザ | おじぎそう（お辞儀草、含羞草） | マメ科 | 〔草〕 | |
| ミモザアカシア | ぎんようアカシア（銀葉Acacia） | マメ科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤギノハギ | ＊ | みやぎのはぎ（宮城野萩） | マメ科 | 〔樹木〕 |
| ミヤコアザミ | ＊ | みやこあざみ（都薊） | キク科 | 〔草〕 |
| ミヤコグサ | ＊ | みやこぐさ（都草） | マメ科 | 〔草〕 |
| ミヤコザサ | ＊ | みやこざさ（都笹） | イネ科 | 〔草〕 |
| ミヤコワスレ | ＊ | みやこわすれ（都忘れ） | キク科 | 〔草〕 |
| ミヤマイヌザクラ | しうりざくら（朱利桜） | バラ科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤマイノデ | おしだ（雄羊歯） | オシダ科 | 〔草〕 | |
| ミヤマイラクサ | ＊ | ミヤマイラクサ（深山刺草） | イラクサ科 | 〔草〕 |
| ミヤマエンレイソウ | しろばななえんれいそう（白花延齢草） | ユリ科 | 〔草〕 | |
| ミヤマオダマキ | ＊ | みやまおだまき（深山苧環） | キンポウゲ科 | 〔草〕 |
| ミヤマカタバミ | ＊ | みやまかたばみ（深山片喰、深山酢漿草） | カタバミ科 | 〔草〕 |
| ミヤマガンショウ | ＊ | みやまがんしょう（深山含笑） | モクレン科 | 〔樹木〕 |
| ミヤマキリシマ | ＊ | みやまきりしま（深山霧島） | ツツジ科 | 〔樹木〕 |
| ミヤマクワガタ | きくばくわがた（菊葉鍬形） | ゴマノハグサ科 | 〔草〕 | |
| ミヤマサクラソウ | おおさくらそう（大桜草） | サクラソウ科 | 〔草〕 | |
| ミヤマシキミ | スキミア（Skimmia） | ミカン科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤマシデ | おしだ（雄羊歯） | オシダ科 | 〔草〕 | |
| ミヤマダイコンソウ | ＊ | みやまだいこんそう（深山大根草） | バラ科 | 〔草〕 |
| ミヤマツツジ | むらさきやしおつつじ（紫八汐躑躅、紫八塩躑躅） | ツツジ科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤマトサミズキ | こうやみずき（高野水木） | マンサク科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤマホタルカズラ | みやまほたるかずら（深山蛍葛） | ムラサキ科 | 〔樹木〕 | |
| ミヤママタタビ | ＊ | みやままたたび（深山木天蓼） | マタタビ科 | 〔樹木〕 |
| ミヤマレンゲ | おおやまれんげ（大山蓮華） | モクレン科 | 〔樹木〕 | |
| ミョウガ | ＊ | みょうが（茗荷） | ショウガ科 | 〔草〕 |
| ミラ | にら（韮、韭） | ユリ科 | 〔草〕 | |
| ミラビリス | おしろいばな（白粉花） | オシロイバナ科 | 〔草〕 | |
| ミルククラウン | にちにちそう（日日草） | キョウチクトウ科 | 〔草〕 | |
| ミレット 'パープルマジェスティ | ペニセツム・パープルマジェスティ（Pennisetum 'Purple Majesty'） | イネ科 | 〔草〕 | |
| ミレット・ジェードプリンセス | ＊ | ミレット・ジェードプリンセス（Millet 'Jade Princess'） | イネ科 | 〔草〕 |
| ミント | ＊ | ミント（Mint） | シソ科 | 〔草〕 |